台評會各項評鑑認證計畫之執行，皆以受評單位自訂目標為主軸，透過能貫徹學校發展理念之作法進行委員之篩選與遴聘，針對委員資格將予以全盤審視，儘量維護其獨立及公正運作。對於不同專業領域及學校屬性，尋求合適之委員人選，並提供充分的講習訓練，使其確實瞭解評鑑認證計畫主要目的為協助學校提升辦學成效，避免對學校有刻版印象，或僅以其主觀價值為判斷基準。

學校於申請台評會評鑑認證計畫時，可先提出迴避委員名單，本會於規劃委員人選時將予以排除。另於審查作業正式啟動前，本會將提供預擬之委員名單資料庫，讓受評單位表示意見，並由計畫相關組織針對受評單位所陳述之理由，審議確認後方進行邀約，因此不致產生委員與學校有利益糾葛之狀況。