台評會將透過專家會議確認學校自評指標與評鑑認證指標之異同，在不悖離相關檢核指標意涵之前提下，盡可能尊重學校自評指標。

將不同學校以單一標準加以衡量，可能導致過度指標化以致欠缺特色，因而抑制其多元發展之可能性。台評會所執行評鑑認證計畫之特點在於「尊重」學校辦學特色，以教育目標、辦學特色、學習成效為重點考量，弱化與其他學校相互評比之比較心態；受評單位可依其個別屬性差異及特色，適度增調指標構面之涵蓋要素。

針對受評單位提出之自訂指標內容，台評會將透過專家會議研商確認，在不悖離相關檢核指標意涵之前提下，盡可能尊重受評單位自訂指標。